上一部结尾，尼奥（基奴李维斯 饰）终于意(yì )识到自己的能(🕰)力和使命，中弹复活(🥈)后，变成了无(🏴)所(suǒ )不能的(de )“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯(kǎi )莉·安·摩丝 饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回到了人类的基(✖)地锡(xī )安，受到(🐶)人们的热烈欢迎。　　此时，“母体”决(jué )定先下手为强，派出了两万五千只电子乌贼攻击(jī )锡安基地；墨菲(fēi )斯、尼奥和(hé )崔妮蒂则再次进入“母(🧤)体(tǐ )”，寻找“制钥者(zhě )”，准备从内部破坏；而本该(🌮)被尼奥消灭的特勤史密斯似乎出了点问(🦇)题，脱离了“母体”的控制，拥有可怕(💹)的复制能(😝)力，阻碍尼(🎥)奥他们的行动。